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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

印尼肃贪委正式拘押该国巴布亚省长卢卡斯******

　　中新社雅加达1月11日电 (记者 林永传)印尼肃贪委员会11日以涉嫌贪污受贿犯罪正式拘押该国巴布亚省省长卢卡斯。

　　据印尼媒体当天披露的画面，卢卡斯已穿上橙色囚服并被戴上了手铐。

　　印尼肃贪委员会主席菲尔利·巴胡里 (Firli Bahuri)当天在该国陆军总医院举行的新闻发布会上通报，该委员会怀疑卢卡斯收受了多家承包商的100亿印尼盾(约450万元人民币)酬金，这些酬金与其履行省长职务有关。因健康原因，卢卡斯正在印尼陆军总医院进行临时治疗。

　　卢卡斯是10日中午在巴布亚省会查亚普拉市一家餐馆吃午餐时被印尼肃贪委逮捕的。随后在巴布亚省警察厅特警总部短暂停留后，由特警押护前往机场，随后被押送至雅加达。抵达雅加达后，在印尼肃贪委团队看护下在陆军总医院进行了身体检查。印尼肃贪委发言人透露，该委在巴布亚省警方、情报部门和当地安全部队协助下逮捕了卢卡斯。

　　印尼总统佐科对卢卡斯被逮捕作出回应称，所有公民在法律面前一律平等，必须尊重执法部门的法律程序。

　　印尼肃贪委员会早前已以涉嫌贪污巨额资金为由将卢卡斯列为贪污案嫌犯，并多次传唤其到肃贪委总部接受调查，卢卡斯均以身体有病、不宜前往雅加达为由拒绝。印尼肃贪委不得不派员前往巴布亚省调查，但其住所被数百名支持者看守着，肃贪委办案人员工作受阻挠。

　　据菲尔利介绍，到目前为止，印尼肃贪委已搜查了巴布亚、雅加达、茂物、唐格朗、巴淡岛和苏加武眉等地与该案有关的六个地点，没收了包括金条、黄金首饰和豪华汽车在内的价值数十亿印尼盾的资产。

　　印尼政治、法律和安全事务统筹部长马福德当天在雅加达表示，卢卡斯被拘押后，印尼政府将另外任命巴布亚省代理省长。 (完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）